2000年应用化学专业下增设“环境检测与治理”方向，2003年设置环境工程专业；2007年本专业首届本科生毕业，授予学士学位，2011年获批校特色专业；2011年环境工程获专业学位研究生培养资格，2012年开始招收研究生。2016年环境科学与工程学科获批江苏省“十三五”重点（培育）学科；2018年成为江苏高校中外合作办学高水平示范性建设专业，2022年获批江苏省高校国际化人才培养品牌专业和国家一流本科专业建设点。
本专业立足江苏，面向长三角地区社会经济发展需要，培养掌握污染控制、环境监测与分析、环境影响评价、环境规划与管理、资源综合利用等方面的专业理论与实践技能，在污染控制领域特别是资源综合利用领域，具有从事技术开发、工程设计、环境监测与分析、环保设施运营等工程能力和管理能力的高素质应用型工程技术人才。此外，我校与德国国立大学梅泽堡应用科学大学进行联合办学，通过优势互补、资源共享，培养具有较强专业工作能力的国际化、高素质、复合型、应用型本科人才。
本专业面向全国招收本科生，每年招收学生80人左右，现有在校本科生269人。依托化学与环境工程学院，在环境监测、污染控制和资源综合利用方面具有鲜明的专业特色。现有专任教师23人（含专职实验教师4人），其中教授6名，副教授4名，高级实验师1人；具有博士学位教师（17人）占比73.9%，具有工程背景的教师占比100%；有海外经历的6人，占比26.1%。专任教师年龄及专业结构合理。省“333工程”培养对象2人、省“青蓝工程”学术带头人1人、省“青蓝工程”青年骨干教师3人及省高层次创新创业人才引进计划科技副总12人次。获省部级及以上科研奖励10余项，获批江苏省工程中心、持久性有机污染物（POPs）分析测试中心等省级以上教科研平台8个，有效支撑了专业人才培养。
本专业现有环境工程原理、环境监测和环境工程微生物学等专业基础实验室，水污染控制、大气污染控制、环境工程综合实验、创新实验等专业实验室，电子废弃物资源综合利用、废水处理中试实训平台及环境分析实验中心等，专业实验室面1748㎡，在校生生均使用面积5.9㎡。建立了常州市深水江边污水处理有限公司、维尔利环保科技集团股份有限公司、常州厚德再生资源科技有限公司等14个专业实践基地。
本专业高度重视课程和教材建设，专业教授团队编写了《环境污染治理技术与实训》等教材10部，其中《工业废水处理工艺与设计》为江苏省高等学校重点教材。
本专业以立德树人为根本，坚持“以学生为中心、成果导向、持续改进”的人才培养理念，积极探索人才培养质量提升路径。2014年，专业学生团队获国家级科技创新团队—“小平科技创新团队”（全国唯一非“211”和“985”高校）；近5年，获“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛江苏省选拔赛特等奖1项、二等奖1项、三等奖3项，中国“互联网+”大学生创新创业大赛二等奖1项、三等奖3项，全国大学生节能减排社会实践与科技竞赛二等、三等奖9项，江苏省化学化工领域大学生创新创业作品设计大赛（创意组）5项。获江苏省大学生实践创新训练计划项目70项，公开发表学术论文130余篇，申请国家发明专利100余件。本专业毕业生有的进入英国利兹大学、南京大学、同济大学、中科院生态中心等国内外知名高校和研究所继续深造，部分学生进入国内知名企事业单位工作，受到了用人单位的一致好评。